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       由中国生物化学与分子生物学会主办,西湖大学郭天南教授课题组、西湖智能生物标记物核心实验室、西湖欧米(杭州)生物科技有限公司联合举办的2022年实验室开放月活动于2022年5月21日成功举办。活动以线上讲座形式开展,主题为“蛋白质组大数据和我们的生活”。郭天南课题组的两位博士生梁潇、孙耀庭以及西湖欧米首席AI科学家陈义博士作为此次开放月活动的志愿者和主讲人为线上的听众带来一场有关蛋白质组学研究的科普讲解。

讲座海报

 

        梁潇同学的介绍标题是《蛋白质组学:探秘身体里的微观世界》。他用生动的类比向大家展示了蛋白质和蛋白质组的定义、以及临床蛋白质组学的发展。他以新冠为例子,说明了蛋白质组如何帮助我们预测新冠的轻重症、评估身体各器官的损伤程度、和研究新冠后遗症。

梁潇-蛋白质组:探索身体里的微观世界

 

        在《探秘甲状腺结节蛋白质组密码》部分中,孙耀庭深入浅出地对甲状腺、甲状腺结节、甲状腺癌的关系进行了描述和介绍,并通过一系列统计学数据展示出甲状腺结节与甲状腺的发病情况,以及目前临床面临的严峻诊断难题。团队通过蛋白质组学检测方法结合人工智能,可以辅助临床术前甲状腺结节性质评估,且取得突破性进展。

孙耀庭-探索甲状腺结节蛋白质组密码

 

甲状腺结节与甲状腺癌发病率

 

基于蛋白质的甲状腺结节评估

未来检测甲状腺结节的检测方法

 

        陈义博士讲解了利用AI计算组织、细胞里的蛋白质数量的内容。蛋白质定量是生命科学领域重要工作之一,定量结果可以用于诊断疾病、研究生物运行规律。科学家使用质谱仪分析生物样品,区分样品中含有的蛋白质,并给它们定量。但测量过程中的误差、噪声会带来准确性方面的问题。AI模型在蛋白质鉴定中也获得越来越广泛的应用,例如,DreamDIA等软件就利用AI模型从实验质谱图中获取有用信息,解决实验质谱噪声和误差的问题。

陈义-AI怎么计算组织、细胞里的蛋白质数量

 

通过蛋白质定量研究,科学家发现有些蛋白质的含量随时间有节律地变化

 

使用级联质谱仪测量得到的数据,可以区分任意两种蛋白质,并给它们定量

 

一些蛋白质定量软件利用AI模型从实验质谱图中获取有用信息,解决实验质谱噪声和误差的问题

 

AI模型善于从复杂数据中提取有用信息,被广泛应用于图像识别等领域

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